iPhone OS 3.0.1アップデート後の実機でのデバッグ方法

Appleに解決策のPDFがあります。
Unauthorized - Apple Developer

とっても簡単で、下記のようにシンボリックリンクを張るというだけです。

ln -s /Developer/Platforms/iPhoneOS.platform/DeviceSupport/3.0\ \(7A341\) /Developer/Platforms/iPhoneOS.platform/DeviceSupport/3.0.1